La Academia emergió de una unificación entre los clubes Football Club Barracas al Sud y Colorados Unidos del Sud. Recién adoptó sus colores emblemáticos celeste y blanco a partir de 1910, a modo de homenaje del centenario de la Primera Junta. Logró un hito mundial al convertirse en el primer heptacampeón de Liga cuando conquistó los títulos consecutivos desde 1913 hasta 1919. Escolta de Boca en la tabla de títulos de Copas nacionales, fue subcampeón en la edición 2011-2012 de la competencia integradora: cayó justamente ante el Xeneize.